วัดสำคัญและใหญ่ที่สุดของจังหวัดนากาโนะ โดยเป็นวัดเก่าแก่ที่สามารถสืบสาวเรื่องราวการก่อตั้งไปได้ไกลถึงปีคศ.642 หรือราวเกือบ1400 ปีมาแล้ว
เมื่อปีนั้นมีพระพุทธรูปจากอินเดียถูกส่งมายังญี่ปุ่นและนำมาประดิษฐานที่บริเวณนี้โดยคนที่ชื่อฮอนดะ โยชิมิตสึ จึงทำให้มีคนมาสักการะบูชาและก่อตั้งเป็นวัดขึ้นมา ส่วนชื่อวัดเซ็นโคจินั้น แปลตรงๆมีความหมายว่า “วัดของโยชิมิตสึ” นั่นเอง
พระพุทธรูปของจริงนั้นเชื่อกันว่าเป็นพระพุทธรูปองค์แรกที่ถูกนำมาที่ญี่ปุ่น ในตอนนี้ว่ากันว่าถูกซ่อนอยู่ในบริเวณวัด แต่ไม่มีใครได้รับอนุญาติให้เข้าชมแม้แต่คนเดียวรวมถึงเจ้าอาวาสด้วยครับ แต่จะมีการเปิดให้เข้าชมพระพุทธรูปองค์จำลองทุกๆหกปี เป็นเทศกาลที่ยิ่งใหญ่ ครั้งล่าสุดเพิ่งผ่านไปเมื่อเมษายนปี2015นี่เอง กว่าจะได้เห็นอีกครั้งก็คงต้องรอปี2021ครับ
