พิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำแห่งนี้ประกอบด้วยอาคารเหนือ ที่จัดแสดงปลาวาฬเพชฌฆาต ปลาวาฬขาว แมวน้ำ และการแสดงสุดยอดปลาโลมาแสนรู้ เป็นต้นค่ะ และในส่วนอาคารใต้ ได้มีการแบ่งแยกประเภทของสัตว์น้ำทะเลไว้เป็น 5ประเภท เริ่มจากทะเลบริเวณโดยรอบของประเทศญี่ปุ่นไปจนถึงบริเวณมหาสมุทรแอนตาร์กติก้า ในภายใต้คอนเซปต์ “เที่ยวสู่ขั้วโลกใต้ ” นอกจากนี้ยังมีอุโมงค์ใต้น้ำจำลองและแนวปะการัง ไว้ให้นักท่องเที่ยวได้เข้าชมสีสันของปลาในเขตร้อน พร้อมกับชมนกเพนกวินแห่งแอนตาร์กติกอีกด้วยค่ะ
